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Internationales Konsortium stellt Richtlinien und Praxisempfehlungen für die Erforschung
neuer Viren auf
Wien (universität) - Mikroorganismen in auf und um unseren Planeten wird nachgesagt in ihrer Zahl die
Anzahl der Sterne in der Milchstraße zu übersteigen. Die Gesamtanzahl der Viren ist jedoch um ein Vielfaches
höher. Zahlreiche Arten sind derzeit noch unbekannt und der Forschung nicht zugänglich. Die Anzahl derartiger
Datensätze verdreifacht sich jedes Jahr. Ein internationales Forschungsteam um den Mikrobiologen Thomas Rattei
von der Universität Wien hat nun neue Standards zur Einordnung der Forschungsdaten definiert. Die Ergebnisse
erscheinen aktuell im Fachjournal Nature Biotechnology.
Um einheitliche Qualitätsstandards in diesem wichtigen Forschungsbereich einzuführen, hat sich vor zwei
Jahren ein internationales Konsortium formiert. Seitens der Universität Wien arbeitete Thomas Rattei vom Department
für Mikrobiologie und Ökosystemforschung in dieser Gruppe mit. Das Team um den Mikrobiologen erforscht
seit Jahren die Evolution viraler Proteinfamilien und entwickelt dafür spezielle Bioinformatik-Werkzeuge und
-Datenbanken. Rattei argumentiert: "Viren sind nicht nur wichtige Krankheitserreger des Menschen, sondern
essenzielle Bestandteile aller Ökosysteme. Deren Erforschung mit Hilfe moderner Genomik-Methoden ist nur möglich,
wenn die erzeugten großen Datenmengen einheitlichen Qualitätsstandards gehorchen."
Das internationale Forschungsteam hat Inhalt und Struktur der minimalen Informationen definiert, die in der Genomforschung
unkultivierbarer Viren wichtig sind. Dies umfasst Angaben zu Probenmaterial, Virus-Identifikation, Sequenzierung
und Datenqualität. Die Angabe dieser Informationen wird für künftige Forschungsprojekte obligatorisch
sein. Im Rahmen der aktuellen Publikation im Fachjournal Nature Biotechnology werden diese neuen Standards vorgestellt
und durch Richtlinien und Praxisempfehlungen ergänzt.
Eine zentrale Rolle nahm bei der Koordination dieses Projekts das "Genomic Standards Consortium (GSC)"
ein. Diese, für alle WissenschafterInnen offene, Gemeinschaft engagiert sich seit vielen Jahren für die
Erstellung von Standards in der Genomforschung und hat schon zahlreiche internationale Projekte in diesem Bereich
koordiniert. Vom 20. Bis 23. Mai 2019 wird das GSC auch seine Jahrestagung an der Universität Wien abhalten.
"Diese Standards schließen eine wichtige Lücke und sind ein wirksames Instrument, um angesichts
des massiven Wachstums der Sequenzdaten von Viren und Mikroorganismen vergleichende Analysen durchführen zu
können", so Rattei und ergänzt: "Sie bieten die Möglichkeit, Barrieren für den Datenaustausch
niederzubrechen und die Reproduzierbarkeit der Genomforschung sicherzustellen. Die Notwendigkeiten sehen wir BioinformatikerInnen
in unserer täglichen Arbeit immer wieder."
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